D3206次动车从厦门北站到南通站总共有21站，12:54发车，20:52到达，全程耗时约7小时58分钟。
D3206次动车时刻表经过的站点有厦门北站、晋江站、泉州站、莆田站、福清站、福州南站、宁德站、霞浦站、苍南站、温州南站、乐清站、温岭站、三门县站、宁波站、余姚北站、绍兴东站、杭州南站、杭州东站、嘉兴南站、金山北站、上海虹桥站，如果您需要购买D3206次动车该车次车票，您可以访问12306或到指定票务窗口直接订票。
D3206次动车途经站点及时刻表
始发站：厦门北，发车时间：12:54，终点站：上海虹桥，到达时间：20:52，总耗时：7小时58分钟。。
| 站名 | 进站时间 | 发车时间 | 停留时间 |
|---|---|---|---|
| 厦门北 | 12:54 | 12:54 | ---- |
| 晋江 | 13:12 | 13:14 | 2 分钟 |
| 泉州 | 13:26 | 13:28 | 2 分钟 |
| 莆田 | 13:54 | 13:56 | 2 分钟 |
| 福清 | 14:17 | 14:19 | 2 分钟 |
| 福州南 | 14:35 | 14:39 | 4 分钟 |
| 宁德 | 15:13 | 15:15 | 2 分钟 |
| 霞浦 | 15:37 | 15:39 | 2 分钟 |
| 苍南 | 16:10 | 16:12 | 2 分钟 |
| 温州南 | 16:35 | 16:37 | 2 分钟 |
| 乐清 | 16:52 | 16:54 | 2 分钟 |
| 温岭 | 17:20 | 17:22 | 2 分钟 |
| 三门县 | 17:47 | 17:49 | 2 分钟 |
| 宁波 | 18:30 | 18:34 | 4 分钟 |
| 余姚北 | 18:55 | 18:57 | 2 分钟 |
| 绍兴东 | 19:09 | 19:11 | 2 分钟 |
| 杭州南 | 19:32 | 19:36 | 4 分钟 |
| 杭州东 | 19:46 | 19:50 | 4 分钟 |
| 嘉兴南 | 20:14 | 20:16 | 2 分钟 |
| 金山北 | 20:30 | 20:32 | 2 分钟 |
| 上海虹桥 | 20:52 | 20:52 | ---- |