G5939次高铁列车从阜阳西站到杭州西站总共有12站，16:40发车，20:58到达，全程耗时约4小时18分钟。
G5939次高铁列车时刻表经过的站点有阜阳西站、凤台南站、淮南南站、合肥南站、巢湖东站、芜湖站、芜湖南站、宣城站、郎溪南站、安吉站、湖州站、杭州西站，如果您需要购买G5939次高铁列车该车次车票，您可以访问12306或到指定票务窗口直接订票。
G5939次高铁列车途经站点及时刻表
始发站：阜阳西，发车时间：16:40，终点站：杭州西，到达时间：20:58，总耗时：4小时18分钟。。
| 站名 | 进站时间 | 发车时间 | 停留时间 |
|---|---|---|---|
| 阜阳西 | ---- | 16:40 | ---- |
| 凤台南 | 17:04 | 17:10 | 6 分钟 |
| 淮南南 | 17:24 | 17:26 | 2 分钟 |
| 合肥南 | 18:04 | 18:09 | 5 分钟 |
| 巢湖东 | 18:30 | 18:41 | 11 分钟 |
| 芜湖 | 19:02 | 19:04 | 2 分钟 |
| 芜湖南 | 19:15 | 19:22 | 7 分钟 |
| 宣城 | 19:43 | 19:45 | 2 分钟 |
| 郎溪南 | 19:58 | 20:00 | 2 分钟 |
| 安吉 | 20:15 | 20:17 | 2 分钟 |
| 湖州 | 20:33 | 20:35 | 2 分钟 |
| 杭州西 | 20:58 | 20:58 | ---- |