第1步：申请单位填写《保税仓库申请书》，向主管海关提出设立申请，并向海关提交下列单证：
1、书面申请报告；
2、工商营业执照副本，如系租赁仓库，还应提供租赁仓库的工商营业执照副本；
3、税务登记证明副本；
4、外经贸主管部门批准经营有关业务的批件；
5、企业可行性研究报告、章程或协议；
6、保税仓库管理制度；
7、海关需要的其他有关资料：如租赁仓库的租赁协议、仓库位置平面图、自理或代理报关注册登记证书副本等。
第2步：主管海关审核申请资料并派员实地勘查。
第3步：主管海关初审通过后，报上海海关加工贸易监管处。
第4步：上海海关加工贸易监管处根据分级审批程序上报海关总署审批或备案。海关总署同意设库的，颁发《保税仓库登记证书》和保税仓库标牌。